适宜条件 有机白灵菇贮藏的最适温度为-0.5～0.5℃。温度过高会加快色变或衰老，甚至腐烂;过低又会造成冷害或冻害。贮藏环境的空气相对湿度以95%～100%为宜。低氧气或高二氧化碳浓度的环境有利于有机白灵菇的保鲜。
采收要点 当有机白灵菇菌盖充分展开，孢子未大量释放时采收。要轻采、轻拿、轻装，减少机械碰撞与损伤，用利刀削平菇柄，毛刷刷净菇体杂物，并剔除畸形、破损和带病虫的菇。要求菌盖完整，菌盖(掌形菇)7～15厘米，菇色洁白，菌肉坚实，柄长不超过2厘米。单个重150克左右时最受市场欢迎，售价也较高。 保鲜剂处理 采后及时用0.01%～0.02%山梨酸钾、苯甲酸钠或0.1%～0.5%焦亚硫酸钠漂洗5～6分钟。
预冷 将经过分级、修整、处理后的鲜菇放入塑料筐中，及时移入0～1℃的冷库中充分预冷，一般以15～20小时为宜。 包装、冷藏 将有机白灵菇用食品纸包装后，放入内衬聚氯乙烯(PVC)保鲜袋的塑料周转筐、泡沫箱或纸箱内，扎紧袋口，双层袋的贮藏效果好于单层袋，每箱以5～10千克为宜。在0℃左右的条件下，可贮藏50～60天，无开伞、发霉、褐变等现象，风味也无明显变化。
